Výzkum

Oddělení rostlinné virologie se zabývá výzkumem molekulárních patogenů rostlin - virů, fytoplazem a bakterií.

Viry

• Vývoj nových molekulárních metod pro detekci virů - real-time PCR, mikročipy (microarrays)
• Hledání nových, dosud nepopsaných virů
• Přenos a množení virů v laboratorních hostitelských rostlinách
• Imunizace a příprava antisér proti přírodním i rekombinantním virovým proteinům
• Zjišťování virů pomocí metod založených na detekci nukleové kyseliny a ELISA testů
• Analýza a exprese virových genomů
• Studie molekulární variability a evoluce comovirů
• Vyhledávání, identifikace a sekvenování genomu bakteriofágů a jejich využití při ochraně rostlin
• Exprese fágových lytických enzymů jako prostředek proti bakteriím rezistentním k antibiotikům
• dr. I.Koloniuk a prof. K.Petrzik jsou, pořadě, členy studijní skupiny pro Hypoviry a studijní skupiny pro Secoviry Mezinárodní komise pro taxonomii virů (ICTV)
• prof. K.Petrzik je sekčním editorem časopisu Virus Genes (Springer)

Fytoplazmy

• Detekce, identifikace a charakterizace fytoplazem pomocí PCR amplifikace, RFLP analýzy, sekvenování vybraných genů, přenosu na barvínek a pozorování v elektronovém mikroskopu
• Vývoj nových molekulárních metod pro detekci fytoplazem - mikročipy (microarrays)
• Studie výskytu fytoplazem a jejich variability
• Hledání a analýza genomů fytoplazmových plazmidů