Datum: 19.02.2016

Objevili jsme pět nových virů

Pět nových rostlinných virů popsali během loňského roku virologové z Ústavu molekulární biologie rostlin Biologického centra AV ČR. K jejich hledání používají celý arzenál nejrůznějších vědeckých metod, včetně nejmodernějšího sekvenování nové generace (NGS - next generation sequencing).

Zatímco klasickým sekvenováním bylo možné “přečíst” jen předem vybrané, krátké kousky dědičné informace, technologie NGS dovede najednou zobrazit veškerou dědičnou informaci obsaženou v daném vzorku. Není to ale zas tak jednoduché, protože získaná informace je rozstříhaná na menší kousíčky o cca 100 – 150 písmenkách, a ty je nejprve potřeba správně složit. Vlastně nejprve rozstříháte Shakespearův román, do toho několik dalších knih, přimícháte stejně rozstříhané kratší povídky, okořeníte krátkými vtipy, vše důkladně promícháte, a pak se snažíte všechno zase správně poskládat. Sestavení kompletní dědičné informace virů, která se podobá těm rozstříhaným povídkám, tak může připomínat ono pověstné hledání jehly v kupce sena. Když se ale zadaří, můžete odhalit nejen známé viry, ale i ty, které se množí bez zjevných příznaků virové infekce, či viry, které dosud nebyly popsány vůbec. To se stalo i v tomto případě.  Nově objevené viry se množí v rybízu, třešních a mikroskopických houbách a ukazují, že virový svět je mnohem rozmanitější, než jsme si doposud mysleli.

Zpět

 

KONTAKT

Biologické centrum AV ČR, v.v.i.
Ústav molekulární biologie rostlin
Branišovská 1160/31
370 05 České Budějovice

NAJÍT PRACOVNÍKA